Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
FRMPD1Q5SYB0 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
FRMPD1Q5SYB0 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
FRMPD1Q5SYB0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
FRMPD1Q5SYB0 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
FRMPD1Q5SYB0 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
FRMPD1Q5SYB0 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
FRMPD1Q5SYB0 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
FRMPD1Q5SYB0 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC29.8■■■□□ 2.36
FRMPD1Q5SYB0 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
FRMPD1Q5SYB0 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
FRMPD1Q5SYB0 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
FRMPD1Q5SYB0 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
FRMPD1Q5SYB0 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
FRMPD1Q5SYB0 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
FRMPD1Q5SYB0 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
FRMPD1Q5SYB0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
FRMPD1Q5SYB0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
FRMPD1Q5SYB0 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
FRMPD1Q5SYB0 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
FRMPD1Q5SYB0 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
FRMPD1Q5SYB0 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC29.79■■■□□ 2.36
FRMPD1Q5SYB0 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
FRMPD1Q5SYB0 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
FRMPD1Q5SYB0 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
FRMPD1Q5SYB0 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
FRMPD1Q5SYB0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
FRMPD1Q5SYB0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
FRMPD1Q5SYB0 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
FRMPD1Q5SYB0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
FRMPD1Q5SYB0 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
FRMPD1Q5SYB0 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
FRMPD1Q5SYB0 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
FRMPD1Q5SYB0 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
FRMPD1Q5SYB0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
FRMPD1Q5SYB0 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
FRMPD1Q5SYB0 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
FRMPD1Q5SYB0 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
FRMPD1Q5SYB0 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
FRMPD1Q5SYB0 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
FRMPD1Q5SYB0 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
FRMPD1Q5SYB0 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
FRMPD1Q5SYB0 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
FRMPD1Q5SYB0 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
FRMPD1Q5SYB0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
FRMPD1Q5SYB0 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
FRMPD1Q5SYB0 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
FRMPD1Q5SYB0 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC29.77■■■□□ 2.36
FRMPD1Q5SYB0 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
FRMPD1Q5SYB0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
FRMPD1Q5SYB0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
FRMPD1Q5SYB0 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
FRMPD1Q5SYB0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
FRMPD1Q5SYB0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
FRMPD1Q5SYB0 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
FRMPD1Q5SYB0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
FRMPD1Q5SYB0 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
FRMPD1Q5SYB0 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
FRMPD1Q5SYB0 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
FRMPD1Q5SYB0 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
FRMPD1Q5SYB0 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
FRMPD1Q5SYB0 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
FRMPD1Q5SYB0 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
FRMPD1Q5SYB0 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
FRMPD1Q5SYB0 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
FRMPD1Q5SYB0 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
FRMPD1Q5SYB0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
FRMPD1Q5SYB0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
FRMPD1Q5SYB0 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
FRMPD1Q5SYB0 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
FRMPD1Q5SYB0 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
FRMPD1Q5SYB0 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
FRMPD1Q5SYB0 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
FRMPD1Q5SYB0 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
FRMPD1Q5SYB0 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
FRMPD1Q5SYB0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
FRMPD1Q5SYB0 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
FRMPD1Q5SYB0 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
FRMPD1Q5SYB0 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
FRMPD1Q5SYB0 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
FRMPD1Q5SYB0 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
FRMPD1Q5SYB0 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC29.75■■■□□ 2.35
FRMPD1Q5SYB0 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
FRMPD1Q5SYB0 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
FRMPD1Q5SYB0 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
FRMPD1Q5SYB0 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
FRMPD1Q5SYB0 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
FRMPD1Q5SYB0 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
FRMPD1Q5SYB0 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
FRMPD1Q5SYB0 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC29.74■■■□□ 2.35
FRMPD1Q5SYB0 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
FRMPD1Q5SYB0 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
FRMPD1Q5SYB0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
FRMPD1Q5SYB0 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
FRMPD1Q5SYB0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
FRMPD1Q5SYB0 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
FRMPD1Q5SYB0 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
FRMPD1Q5SYB0 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
FRMPD1Q5SYB0 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
FRMPD1Q5SYB0 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms