Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDE5

SVEP1, Sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 3,571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVEP1Q4LDE5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SVEP1Q4LDE5 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SVEP1Q4LDE5 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SVEP1Q4LDE5 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SVEP1Q4LDE5 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SVEP1Q4LDE5 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SVEP1Q4LDE5 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SVEP1Q4LDE5 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SVEP1Q4LDE5 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SVEP1Q4LDE5 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SVEP1Q4LDE5 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SVEP1Q4LDE5 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SVEP1Q4LDE5 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SVEP1Q4LDE5 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SVEP1Q4LDE5 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SVEP1Q4LDE5 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SVEP1Q4LDE5 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SVEP1Q4LDE5 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SVEP1Q4LDE5 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SVEP1Q4LDE5 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SVEP1Q4LDE5 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SVEP1Q4LDE5 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SVEP1Q4LDE5 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SVEP1Q4LDE5 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SVEP1Q4LDE5 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SVEP1Q4LDE5 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SVEP1Q4LDE5 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SVEP1Q4LDE5 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SVEP1Q4LDE5 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SVEP1Q4LDE5 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SVEP1Q4LDE5 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SVEP1Q4LDE5 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SVEP1Q4LDE5 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SVEP1Q4LDE5 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SVEP1Q4LDE5 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SVEP1Q4LDE5 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SVEP1Q4LDE5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SVEP1Q4LDE5 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SVEP1Q4LDE5 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SVEP1Q4LDE5 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SVEP1Q4LDE5 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SVEP1Q4LDE5 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms