Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TWISTNBQ3B726 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TWISTNBQ3B726 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TWISTNBQ3B726 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TWISTNBQ3B726 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TWISTNBQ3B726 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TWISTNBQ3B726 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TWISTNBQ3B726 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TWISTNBQ3B726 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TWISTNBQ3B726 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TWISTNBQ3B726 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TWISTNBQ3B726 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TWISTNBQ3B726 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TWISTNBQ3B726 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TWISTNBQ3B726 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TWISTNBQ3B726 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TWISTNBQ3B726 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TWISTNBQ3B726 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TWISTNBQ3B726 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TWISTNBQ3B726 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TWISTNBQ3B726 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TWISTNBQ3B726 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TWISTNBQ3B726 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TWISTNBQ3B726 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TWISTNBQ3B726 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TWISTNBQ3B726 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TWISTNBQ3B726 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TWISTNBQ3B726 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TWISTNBQ3B726 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TWISTNBQ3B726 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TWISTNBQ3B726 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TWISTNBQ3B726 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TWISTNBQ3B726 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TWISTNBQ3B726 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TWISTNBQ3B726 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TWISTNBQ3B726 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TWISTNBQ3B726 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TWISTNBQ3B726 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TWISTNBQ3B726 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TWISTNBQ3B726 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TWISTNBQ3B726 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TWISTNBQ3B726 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TWISTNBQ3B726 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TWISTNBQ3B726 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TWISTNBQ3B726 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TWISTNBQ3B726 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TWISTNBQ3B726 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TWISTNBQ3B726 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TWISTNBQ3B726 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TWISTNBQ3B726 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TWISTNBQ3B726 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TWISTNBQ3B726 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TWISTNBQ3B726 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TWISTNBQ3B726 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TWISTNBQ3B726 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TWISTNBQ3B726 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TWISTNBQ3B726 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms