Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 827 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SKIDA1Q1XH10 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SKIDA1Q1XH10 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SKIDA1Q1XH10 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SKIDA1Q1XH10 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SKIDA1Q1XH10 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SKIDA1Q1XH10 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SKIDA1Q1XH10 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SKIDA1Q1XH10 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SKIDA1Q1XH10 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SKIDA1Q1XH10 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SKIDA1Q1XH10 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SKIDA1Q1XH10 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SKIDA1Q1XH10 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SKIDA1Q1XH10 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SKIDA1Q1XH10 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SKIDA1Q1XH10 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SKIDA1Q1XH10 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SKIDA1Q1XH10 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SKIDA1Q1XH10 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SKIDA1Q1XH10 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SKIDA1Q1XH10 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SKIDA1Q1XH10 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SKIDA1Q1XH10 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SKIDA1Q1XH10 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SKIDA1Q1XH10 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SKIDA1Q1XH10 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SKIDA1Q1XH10 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SKIDA1Q1XH10 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SKIDA1Q1XH10 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SKIDA1Q1XH10 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SKIDA1Q1XH10 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SKIDA1Q1XH10 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SKIDA1Q1XH10 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SKIDA1Q1XH10 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SKIDA1Q1XH10 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SKIDA1Q1XH10 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SKIDA1Q1XH10 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SKIDA1Q1XH10 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SKIDA1Q1XH10 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SKIDA1Q1XH10 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SKIDA1Q1XH10 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SKIDA1Q1XH10 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SKIDA1Q1XH10 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SKIDA1Q1XH10 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SKIDA1Q1XH10 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SKIDA1Q1XH10 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SKIDA1Q1XH10 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SKIDA1Q1XH10 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SKIDA1Q1XH10 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SKIDA1Q1XH10 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SKIDA1Q1XH10 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SKIDA1Q1XH10 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SKIDA1Q1XH10 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SKIDA1Q1XH10 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SKIDA1Q1XH10 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SKIDA1Q1XH10 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SKIDA1Q1XH10 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SKIDA1Q1XH10 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SKIDA1Q1XH10 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SKIDA1Q1XH10 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SKIDA1Q1XH10 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SKIDA1Q1XH10 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SKIDA1Q1XH10 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SKIDA1Q1XH10 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SKIDA1Q1XH10 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SKIDA1Q1XH10 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SKIDA1Q1XH10 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SKIDA1Q1XH10 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SKIDA1Q1XH10 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SKIDA1Q1XH10 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SKIDA1Q1XH10 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SKIDA1Q1XH10 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SKIDA1Q1XH10 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SKIDA1Q1XH10 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SKIDA1Q1XH10 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SKIDA1Q1XH10 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SKIDA1Q1XH10 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SKIDA1Q1XH10 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SKIDA1Q1XH10 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SKIDA1Q1XH10 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SKIDA1Q1XH10 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SKIDA1Q1XH10 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SKIDA1Q1XH10 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SKIDA1Q1XH10 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SKIDA1Q1XH10 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SKIDA1Q1XH10 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SKIDA1Q1XH10 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SKIDA1Q1XH10 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SKIDA1Q1XH10 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SKIDA1Q1XH10 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SKIDA1Q1XH10 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SKIDA1Q1XH10 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SKIDA1Q1XH10 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SKIDA1Q1XH10 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SKIDA1Q1XH10 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SKIDA1Q1XH10 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SKIDA1Q1XH10 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SKIDA1Q1XH10 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SKIDA1Q1XH10 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
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