Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms