Protein–RNA interactions for Protein: Q16527

CSRP2, Cysteine and glycine-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP2Q16527 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CSRP2Q16527 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CSRP2Q16527 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CSRP2Q16527 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CSRP2Q16527 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CSRP2Q16527 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CSRP2Q16527 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CSRP2Q16527 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CSRP2Q16527 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CSRP2Q16527 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CSRP2Q16527 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CSRP2Q16527 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CSRP2Q16527 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CSRP2Q16527 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CSRP2Q16527 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CSRP2Q16527 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CSRP2Q16527 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CSRP2Q16527 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CSRP2Q16527 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CSRP2Q16527 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CSRP2Q16527 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CSRP2Q16527 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CSRP2Q16527 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CSRP2Q16527 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CSRP2Q16527 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CSRP2Q16527 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CSRP2Q16527 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CSRP2Q16527 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CSRP2Q16527 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CSRP2Q16527 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CSRP2Q16527 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CSRP2Q16527 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CSRP2Q16527 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CSRP2Q16527 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CSRP2Q16527 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CSRP2Q16527 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CSRP2Q16527 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CSRP2Q16527 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CSRP2Q16527 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CSRP2Q16527 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CSRP2Q16527 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CSRP2Q16527 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
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