Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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SSX1Q16384 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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SSX1Q16384 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
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SSX1Q16384 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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SSX1Q16384 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
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