Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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