Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VPS72Q15906 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
VPS72Q15906 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
VPS72Q15906 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
VPS72Q15906 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VPS72Q15906 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VPS72Q15906 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VPS72Q15906 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VPS72Q15906 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
VPS72Q15906 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
VPS72Q15906 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
VPS72Q15906 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VPS72Q15906 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VPS72Q15906 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
VPS72Q15906 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VPS72Q15906 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
VPS72Q15906 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
VPS72Q15906 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VPS72Q15906 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
VPS72Q15906 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
VPS72Q15906 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
VPS72Q15906 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VPS72Q15906 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VPS72Q15906 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VPS72Q15906 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VPS72Q15906 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
VPS72Q15906 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VPS72Q15906 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VPS72Q15906 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
VPS72Q15906 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VPS72Q15906 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VPS72Q15906 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
VPS72Q15906 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VPS72Q15906 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VPS72Q15906 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VPS72Q15906 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VPS72Q15906 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
VPS72Q15906 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VPS72Q15906 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VPS72Q15906 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VPS72Q15906 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VPS72Q15906 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VPS72Q15906 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VPS72Q15906 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VPS72Q15906 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VPS72Q15906 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VPS72Q15906 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
VPS72Q15906 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VPS72Q15906 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
VPS72Q15906 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
VPS72Q15906 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
VPS72Q15906 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
VPS72Q15906 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
VPS72Q15906 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VPS72Q15906 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VPS72Q15906 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VPS72Q15906 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VPS72Q15906 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
VPS72Q15906 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VPS72Q15906 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VPS72Q15906 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VPS72Q15906 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VPS72Q15906 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
VPS72Q15906 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
VPS72Q15906 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
VPS72Q15906 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
VPS72Q15906 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VPS72Q15906 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VPS72Q15906 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VPS72Q15906 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VPS72Q15906 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
VPS72Q15906 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VPS72Q15906 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
VPS72Q15906 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
VPS72Q15906 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VPS72Q15906 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
VPS72Q15906 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VPS72Q15906 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
VPS72Q15906 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VPS72Q15906 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
VPS72Q15906 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VPS72Q15906 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
VPS72Q15906 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VPS72Q15906 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
VPS72Q15906 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
VPS72Q15906 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VPS72Q15906 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VPS72Q15906 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VPS72Q15906 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
VPS72Q15906 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VPS72Q15906 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
VPS72Q15906 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
VPS72Q15906 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VPS72Q15906 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VPS72Q15906 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VPS72Q15906 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VPS72Q15906 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VPS72Q15906 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VPS72Q15906 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VPS72Q15906 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
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