Protein–RNA interactions for Protein: Q15772

SPEG, Striated muscle preferentially expressed protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 3,267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPEGQ15772 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPEGQ15772 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPEGQ15772 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPEGQ15772 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPEGQ15772 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPEGQ15772 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPEGQ15772 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPEGQ15772 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SPEGQ15772 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPEGQ15772 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPEGQ15772 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SPEGQ15772 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPEGQ15772 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPEGQ15772 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPEGQ15772 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPEGQ15772 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPEGQ15772 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPEGQ15772 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPEGQ15772 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SPEGQ15772 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPEGQ15772 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPEGQ15772 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPEGQ15772 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPEGQ15772 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPEGQ15772 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPEGQ15772 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SPEGQ15772 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPEGQ15772 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPEGQ15772 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPEGQ15772 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPEGQ15772 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPEGQ15772 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPEGQ15772 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPEGQ15772 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPEGQ15772 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPEGQ15772 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPEGQ15772 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPEGQ15772 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SPEGQ15772 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SPEGQ15772 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SPEGQ15772 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPEGQ15772 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPEGQ15772 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPEGQ15772 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPEGQ15772 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SPEGQ15772 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPEGQ15772 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPEGQ15772 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPEGQ15772 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPEGQ15772 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPEGQ15772 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPEGQ15772 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPEGQ15772 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPEGQ15772 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPEGQ15772 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPEGQ15772 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SPEGQ15772 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPEGQ15772 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPEGQ15772 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SPEGQ15772 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPEGQ15772 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPEGQ15772 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPEGQ15772 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SPEGQ15772 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SPEGQ15772 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPEGQ15772 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPEGQ15772 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SPEGQ15772 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPEGQ15772 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPEGQ15772 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPEGQ15772 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SPEGQ15772 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPEGQ15772 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPEGQ15772 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPEGQ15772 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPEGQ15772 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPEGQ15772 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPEGQ15772 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPEGQ15772 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPEGQ15772 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPEGQ15772 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPEGQ15772 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPEGQ15772 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SPEGQ15772 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPEGQ15772 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPEGQ15772 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPEGQ15772 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPEGQ15772 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPEGQ15772 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPEGQ15772 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPEGQ15772 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SPEGQ15772 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SPEGQ15772 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPEGQ15772 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPEGQ15772 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPEGQ15772 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPEGQ15772 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPEGQ15772 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPEGQ15772 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPEGQ15772 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms