Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
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EFNB3Q15768 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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EFNB3Q15768 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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EFNB3Q15768 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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EFNB3Q15768 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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EFNB3Q15768 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNB3Q15768 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
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