Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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