Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
NKX1-1Q15270 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NKX1-1Q15270 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NKX1-1Q15270 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
NKX1-1Q15270 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NKX1-1Q15270 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NKX1-1Q15270 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NKX1-1Q15270 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NKX1-1Q15270 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NKX1-1Q15270 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NKX1-1Q15270 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NKX1-1Q15270 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NKX1-1Q15270 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NKX1-1Q15270 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NKX1-1Q15270 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NKX1-1Q15270 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NKX1-1Q15270 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NKX1-1Q15270 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NKX1-1Q15270 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NKX1-1Q15270 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NKX1-1Q15270 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NKX1-1Q15270 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NKX1-1Q15270 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NKX1-1Q15270 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NKX1-1Q15270 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NKX1-1Q15270 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NKX1-1Q15270 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NKX1-1Q15270 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NKX1-1Q15270 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NKX1-1Q15270 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NKX1-1Q15270 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NKX1-1Q15270 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NKX1-1Q15270 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NKX1-1Q15270 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NKX1-1Q15270 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NKX1-1Q15270 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NKX1-1Q15270 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NKX1-1Q15270 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NKX1-1Q15270 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NKX1-1Q15270 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NKX1-1Q15270 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NKX1-1Q15270 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NKX1-1Q15270 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NKX1-1Q15270 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NKX1-1Q15270 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NKX1-1Q15270 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NKX1-1Q15270 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NKX1-1Q15270 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NKX1-1Q15270 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NKX1-1Q15270 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NKX1-1Q15270 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
NKX1-1Q15270 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NKX1-1Q15270 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NKX1-1Q15270 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NKX1-1Q15270 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NKX1-1Q15270 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NKX1-1Q15270 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
NKX1-1Q15270 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NKX1-1Q15270 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
NKX1-1Q15270 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
NKX1-1Q15270 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NKX1-1Q15270 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NKX1-1Q15270 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
NKX1-1Q15270 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NKX1-1Q15270 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NKX1-1Q15270 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NKX1-1Q15270 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NKX1-1Q15270 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
NKX1-1Q15270 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NKX1-1Q15270 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NKX1-1Q15270 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
NKX1-1Q15270 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NKX1-1Q15270 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NKX1-1Q15270 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NKX1-1Q15270 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
NKX1-1Q15270 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
NKX1-1Q15270 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
NKX1-1Q15270 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NKX1-1Q15270 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NKX1-1Q15270 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
NKX1-1Q15270 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NKX1-1Q15270 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
NKX1-1Q15270 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NKX1-1Q15270 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NKX1-1Q15270 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NKX1-1Q15270 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NKX1-1Q15270 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NKX1-1Q15270 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NKX1-1Q15270 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NKX1-1Q15270 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NKX1-1Q15270 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NKX1-1Q15270 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NKX1-1Q15270 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NKX1-1Q15270 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NKX1-1Q15270 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NKX1-1Q15270 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NKX1-1Q15270 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NKX1-1Q15270 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NKX1-1Q15270 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NKX1-1Q15270 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms