Protein–RNA interactions for Protein: Q15054

POLD3, DNA polymerase delta subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD3Q15054 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
POLD3Q15054 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
POLD3Q15054 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
POLD3Q15054 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
POLD3Q15054 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLD3Q15054 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLD3Q15054 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLD3Q15054 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLD3Q15054 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLD3Q15054 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLD3Q15054 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLD3Q15054 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLD3Q15054 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLD3Q15054 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLD3Q15054 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLD3Q15054 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLD3Q15054 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLD3Q15054 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLD3Q15054 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLD3Q15054 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLD3Q15054 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLD3Q15054 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
POLD3Q15054 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLD3Q15054 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLD3Q15054 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLD3Q15054 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLD3Q15054 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLD3Q15054 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLD3Q15054 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLD3Q15054 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLD3Q15054 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLD3Q15054 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLD3Q15054 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
POLD3Q15054 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLD3Q15054 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLD3Q15054 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLD3Q15054 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLD3Q15054 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLD3Q15054 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLD3Q15054 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLD3Q15054 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLD3Q15054 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLD3Q15054 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLD3Q15054 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLD3Q15054 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLD3Q15054 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLD3Q15054 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
POLD3Q15054 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLD3Q15054 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLD3Q15054 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLD3Q15054 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLD3Q15054 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLD3Q15054 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLD3Q15054 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLD3Q15054 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLD3Q15054 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLD3Q15054 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLD3Q15054 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLD3Q15054 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLD3Q15054 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLD3Q15054 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLD3Q15054 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLD3Q15054 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLD3Q15054 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLD3Q15054 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLD3Q15054 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLD3Q15054 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLD3Q15054 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLD3Q15054 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLD3Q15054 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLD3Q15054 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLD3Q15054 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLD3Q15054 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
POLD3Q15054 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLD3Q15054 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLD3Q15054 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLD3Q15054 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLD3Q15054 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms