Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
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