Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms