Protein–RNA interactions for Protein: Q14CN2

CLCA4, Calcium-activated chloride channel regulator 4, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA4Q14CN2 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CLCA4Q14CN2 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CLCA4Q14CN2 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CLCA4Q14CN2 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CLCA4Q14CN2 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CLCA4Q14CN2 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CLCA4Q14CN2 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CLCA4Q14CN2 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CLCA4Q14CN2 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CLCA4Q14CN2 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CLCA4Q14CN2 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CLCA4Q14CN2 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CLCA4Q14CN2 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CLCA4Q14CN2 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CLCA4Q14CN2 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CLCA4Q14CN2 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CLCA4Q14CN2 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CLCA4Q14CN2 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CLCA4Q14CN2 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CLCA4Q14CN2 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CLCA4Q14CN2 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CLCA4Q14CN2 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CLCA4Q14CN2 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CLCA4Q14CN2 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CLCA4Q14CN2 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
CLCA4Q14CN2 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CLCA4Q14CN2 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CLCA4Q14CN2 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
CLCA4Q14CN2 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CLCA4Q14CN2 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CLCA4Q14CN2 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
CLCA4Q14CN2 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CLCA4Q14CN2 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
CLCA4Q14CN2 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
CLCA4Q14CN2 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CLCA4Q14CN2 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CLCA4Q14CN2 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CLCA4Q14CN2 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CLCA4Q14CN2 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CLCA4Q14CN2 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CLCA4Q14CN2 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CLCA4Q14CN2 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CLCA4Q14CN2 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CLCA4Q14CN2 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CLCA4Q14CN2 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CLCA4Q14CN2 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CLCA4Q14CN2 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CLCA4Q14CN2 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CLCA4Q14CN2 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CLCA4Q14CN2 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CLCA4Q14CN2 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CLCA4Q14CN2 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CLCA4Q14CN2 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CLCA4Q14CN2 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CLCA4Q14CN2 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CLCA4Q14CN2 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CLCA4Q14CN2 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CLCA4Q14CN2 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CLCA4Q14CN2 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CLCA4Q14CN2 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CLCA4Q14CN2 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CLCA4Q14CN2 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CLCA4Q14CN2 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CLCA4Q14CN2 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CLCA4Q14CN2 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CLCA4Q14CN2 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CLCA4Q14CN2 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CLCA4Q14CN2 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CLCA4Q14CN2 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CLCA4Q14CN2 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CLCA4Q14CN2 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CLCA4Q14CN2 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CLCA4Q14CN2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CLCA4Q14CN2 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CLCA4Q14CN2 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CLCA4Q14CN2 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CLCA4Q14CN2 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CLCA4Q14CN2 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CLCA4Q14CN2 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CLCA4Q14CN2 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CLCA4Q14CN2 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CLCA4Q14CN2 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CLCA4Q14CN2 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CLCA4Q14CN2 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CLCA4Q14CN2 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CLCA4Q14CN2 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CLCA4Q14CN2 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CLCA4Q14CN2 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CLCA4Q14CN2 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CLCA4Q14CN2 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CLCA4Q14CN2 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CLCA4Q14CN2 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CLCA4Q14CN2 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
CLCA4Q14CN2 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CLCA4Q14CN2 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CLCA4Q14CN2 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CLCA4Q14CN2 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CLCA4Q14CN2 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CLCA4Q14CN2 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CLCA4Q14CN2 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
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