Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms