Protein–RNA interactions for Protein: Q14011

CIRBP, Cold-inducible RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBPQ14011 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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