Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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