Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
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