Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
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