Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATMQ13315 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATMQ13315 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATMQ13315 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATMQ13315 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATMQ13315 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATMQ13315 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATMQ13315 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATMQ13315 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATMQ13315 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATMQ13315 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATMQ13315 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATMQ13315 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATMQ13315 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATMQ13315 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ATMQ13315 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATMQ13315 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATMQ13315 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATMQ13315 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATMQ13315 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATMQ13315 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATMQ13315 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ATMQ13315 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATMQ13315 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATMQ13315 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATMQ13315 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATMQ13315 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATMQ13315 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATMQ13315 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATMQ13315 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATMQ13315 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ATMQ13315 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATMQ13315 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATMQ13315 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATMQ13315 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATMQ13315 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATMQ13315 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATMQ13315 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATMQ13315 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATMQ13315 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATMQ13315 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATMQ13315 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATMQ13315 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATMQ13315 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATMQ13315 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATMQ13315 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATMQ13315 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATMQ13315 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATMQ13315 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATMQ13315 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATMQ13315 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATMQ13315 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATMQ13315 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATMQ13315 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATMQ13315 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATMQ13315 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATMQ13315 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATMQ13315 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATMQ13315 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATMQ13315 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATMQ13315 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATMQ13315 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATMQ13315 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ATMQ13315 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATMQ13315 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATMQ13315 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATMQ13315 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATMQ13315 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATMQ13315 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATMQ13315 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATMQ13315 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATMQ13315 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATMQ13315 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATMQ13315 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATMQ13315 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATMQ13315 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATMQ13315 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATMQ13315 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATMQ13315 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATMQ13315 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATMQ13315 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATMQ13315 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATMQ13315 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ATMQ13315 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATMQ13315 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ATMQ13315 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATMQ13315 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATMQ13315 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATMQ13315 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATMQ13315 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATMQ13315 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATMQ13315 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATMQ13315 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATMQ13315 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATMQ13315 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATMQ13315 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATMQ13315 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATMQ13315 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATMQ13315 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATMQ13315 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
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