Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHAF1AQ13111 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHAF1AQ13111 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CHAF1AQ13111 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CHAF1AQ13111 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHAF1AQ13111 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHAF1AQ13111 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHAF1AQ13111 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHAF1AQ13111 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHAF1AQ13111 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHAF1AQ13111 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHAF1AQ13111 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHAF1AQ13111 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHAF1AQ13111 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHAF1AQ13111 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHAF1AQ13111 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHAF1AQ13111 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHAF1AQ13111 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHAF1AQ13111 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHAF1AQ13111 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHAF1AQ13111 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHAF1AQ13111 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CHAF1AQ13111 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CHAF1AQ13111 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHAF1AQ13111 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHAF1AQ13111 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHAF1AQ13111 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHAF1AQ13111 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHAF1AQ13111 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHAF1AQ13111 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHAF1AQ13111 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHAF1AQ13111 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHAF1AQ13111 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHAF1AQ13111 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHAF1AQ13111 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHAF1AQ13111 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHAF1AQ13111 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHAF1AQ13111 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHAF1AQ13111 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHAF1AQ13111 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHAF1AQ13111 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHAF1AQ13111 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHAF1AQ13111 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHAF1AQ13111 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHAF1AQ13111 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHAF1AQ13111 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHAF1AQ13111 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHAF1AQ13111 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHAF1AQ13111 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHAF1AQ13111 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHAF1AQ13111 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHAF1AQ13111 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHAF1AQ13111 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHAF1AQ13111 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHAF1AQ13111 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CHAF1AQ13111 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHAF1AQ13111 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHAF1AQ13111 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHAF1AQ13111 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHAF1AQ13111 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CHAF1AQ13111 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CHAF1AQ13111 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHAF1AQ13111 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHAF1AQ13111 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHAF1AQ13111 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CHAF1AQ13111 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHAF1AQ13111 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHAF1AQ13111 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHAF1AQ13111 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHAF1AQ13111 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHAF1AQ13111 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHAF1AQ13111 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHAF1AQ13111 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHAF1AQ13111 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHAF1AQ13111 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHAF1AQ13111 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHAF1AQ13111 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHAF1AQ13111 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHAF1AQ13111 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHAF1AQ13111 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHAF1AQ13111 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHAF1AQ13111 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHAF1AQ13111 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHAF1AQ13111 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHAF1AQ13111 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHAF1AQ13111 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHAF1AQ13111 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHAF1AQ13111 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHAF1AQ13111 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHAF1AQ13111 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHAF1AQ13111 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHAF1AQ13111 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHAF1AQ13111 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHAF1AQ13111 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHAF1AQ13111 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHAF1AQ13111 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHAF1AQ13111 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHAF1AQ13111 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHAF1AQ13111 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CHAF1AQ13111 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
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