Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GRIK2Q13002 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GRIK2Q13002 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GRIK2Q13002 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GRIK2Q13002 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GRIK2Q13002 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GRIK2Q13002 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GRIK2Q13002 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GRIK2Q13002 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GRIK2Q13002 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GRIK2Q13002 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GRIK2Q13002 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GRIK2Q13002 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GRIK2Q13002 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GRIK2Q13002 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GRIK2Q13002 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GRIK2Q13002 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GRIK2Q13002 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
GRIK2Q13002 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GRIK2Q13002 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GRIK2Q13002 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GRIK2Q13002 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GRIK2Q13002 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GRIK2Q13002 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK2Q13002 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK2Q13002 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK2Q13002 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK2Q13002 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK2Q13002 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK2Q13002 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK2Q13002 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK2Q13002 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK2Q13002 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK2Q13002 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK2Q13002 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK2Q13002 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK2Q13002 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK2Q13002 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK2Q13002 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK2Q13002 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK2Q13002 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK2Q13002 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK2Q13002 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK2Q13002 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK2Q13002 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK2Q13002 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK2Q13002 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK2Q13002 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK2Q13002 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK2Q13002 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK2Q13002 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK2Q13002 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK2Q13002 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK2Q13002 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIK2Q13002 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIK2Q13002 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIK2Q13002 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIK2Q13002 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIK2Q13002 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIK2Q13002 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIK2Q13002 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIK2Q13002 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIK2Q13002 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIK2Q13002 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIK2Q13002 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIK2Q13002 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIK2Q13002 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIK2Q13002 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIK2Q13002 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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