Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
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