Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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