Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
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