Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms