Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
ERCC6Q03468 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
ERCC6Q03468 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
ERCC6Q03468 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
ERCC6Q03468 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
ERCC6Q03468 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
ERCC6Q03468 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
ERCC6Q03468 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
ERCC6Q03468 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
ERCC6Q03468 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
ERCC6Q03468 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
ERCC6Q03468 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
ERCC6Q03468 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
ERCC6Q03468 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
ERCC6Q03468 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
ERCC6Q03468 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
ERCC6Q03468 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
ERCC6Q03468 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
ERCC6Q03468 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
ERCC6Q03468 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
ERCC6Q03468 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
ERCC6Q03468 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
ERCC6Q03468 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
ERCC6Q03468 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
ERCC6Q03468 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
ERCC6Q03468 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
ERCC6Q03468 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
ERCC6Q03468 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
ERCC6Q03468 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.04
ERCC6Q03468 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
ERCC6Q03468 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
ERCC6Q03468 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC34.01■■■■□ 3.04
ERCC6Q03468 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC34.01■■■■□ 3.04
ERCC6Q03468 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
ERCC6Q03468 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
ERCC6Q03468 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
ERCC6Q03468 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
ERCC6Q03468 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC34.01■■■■□ 3.03
ERCC6Q03468 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
ERCC6Q03468 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
ERCC6Q03468 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
ERCC6Q03468 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
ERCC6Q03468 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
ERCC6Q03468 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
ERCC6Q03468 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
ERCC6Q03468 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
ERCC6Q03468 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC34■■■■□ 3.03
ERCC6Q03468 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
ERCC6Q03468 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
ERCC6Q03468 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC34■■■■□ 3.03
ERCC6Q03468 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
ERCC6Q03468 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
ERCC6Q03468 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
ERCC6Q03468 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
ERCC6Q03468 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
ERCC6Q03468 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
ERCC6Q03468 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
ERCC6Q03468 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
ERCC6Q03468 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
ERCC6Q03468 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
ERCC6Q03468 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
ERCC6Q03468 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
ERCC6Q03468 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
ERCC6Q03468 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
ERCC6Q03468 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
ERCC6Q03468 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
ERCC6Q03468 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
ERCC6Q03468 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
ERCC6Q03468 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
ERCC6Q03468 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
ERCC6Q03468 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
ERCC6Q03468 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
ERCC6Q03468 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
ERCC6Q03468 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
ERCC6Q03468 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
ERCC6Q03468 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
ERCC6Q03468 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
ERCC6Q03468 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
ERCC6Q03468 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
ERCC6Q03468 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
ERCC6Q03468 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
ERCC6Q03468 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
ERCC6Q03468 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
ERCC6Q03468 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
ERCC6Q03468 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
ERCC6Q03468 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
ERCC6Q03468 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
ERCC6Q03468 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
ERCC6Q03468 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
ERCC6Q03468 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
ERCC6Q03468 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
ERCC6Q03468 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC33.95■■■■□ 3.03
ERCC6Q03468 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
ERCC6Q03468 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
ERCC6Q03468 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
ERCC6Q03468 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
ERCC6Q03468 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
ERCC6Q03468 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
ERCC6Q03468 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
ERCC6Q03468 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC33.95■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms