Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
APBA1Q02410 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
APBA1Q02410 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
APBA1Q02410 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
APBA1Q02410 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
APBA1Q02410 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APBA1Q02410 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
APBA1Q02410 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
APBA1Q02410 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms