Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms