Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCN7AQ01118 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCN7AQ01118 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCN7AQ01118 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCN7AQ01118 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCN7AQ01118 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCN7AQ01118 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCN7AQ01118 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCN7AQ01118 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCN7AQ01118 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCN7AQ01118 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCN7AQ01118 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCN7AQ01118 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCN7AQ01118 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCN7AQ01118 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCN7AQ01118 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SCN7AQ01118 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCN7AQ01118 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCN7AQ01118 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCN7AQ01118 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCN7AQ01118 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCN7AQ01118 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCN7AQ01118 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCN7AQ01118 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCN7AQ01118 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SCN7AQ01118 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCN7AQ01118 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SCN7AQ01118 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCN7AQ01118 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCN7AQ01118 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCN7AQ01118 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCN7AQ01118 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCN7AQ01118 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCN7AQ01118 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCN7AQ01118 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCN7AQ01118 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCN7AQ01118 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SCN7AQ01118 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCN7AQ01118 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCN7AQ01118 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SCN7AQ01118 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCN7AQ01118 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCN7AQ01118 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCN7AQ01118 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCN7AQ01118 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCN7AQ01118 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCN7AQ01118 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCN7AQ01118 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCN7AQ01118 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCN7AQ01118 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCN7AQ01118 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCN7AQ01118 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCN7AQ01118 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCN7AQ01118 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCN7AQ01118 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCN7AQ01118 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SCN7AQ01118 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCN7AQ01118 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCN7AQ01118 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCN7AQ01118 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCN7AQ01118 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCN7AQ01118 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SCN7AQ01118 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SCN7AQ01118 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCN7AQ01118 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCN7AQ01118 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCN7AQ01118 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCN7AQ01118 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCN7AQ01118 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCN7AQ01118 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCN7AQ01118 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCN7AQ01118 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SCN7AQ01118 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCN7AQ01118 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCN7AQ01118 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCN7AQ01118 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCN7AQ01118 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCN7AQ01118 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCN7AQ01118 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCN7AQ01118 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCN7AQ01118 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCN7AQ01118 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCN7AQ01118 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCN7AQ01118 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCN7AQ01118 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCN7AQ01118 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SCN7AQ01118 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SCN7AQ01118 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCN7AQ01118 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCN7AQ01118 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCN7AQ01118 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCN7AQ01118 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCN7AQ01118 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCN7AQ01118 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCN7AQ01118 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCN7AQ01118 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCN7AQ01118 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCN7AQ01118 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCN7AQ01118 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCN7AQ01118 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms