Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms