Protein–RNA interactions for Protein: P82933

MRPS9, 28S ribosomal protein S9, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS9P82933 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRPS9P82933 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRPS9P82933 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPS9P82933 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPS9P82933 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPS9P82933 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPS9P82933 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPS9P82933 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPS9P82933 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPS9P82933 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPS9P82933 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPS9P82933 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPS9P82933 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPS9P82933 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPS9P82933 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPS9P82933 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPS9P82933 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPS9P82933 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPS9P82933 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPS9P82933 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPS9P82933 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPS9P82933 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPS9P82933 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPS9P82933 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPS9P82933 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPS9P82933 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPS9P82933 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPS9P82933 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPS9P82933 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPS9P82933 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPS9P82933 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPS9P82933 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPS9P82933 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPS9P82933 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPS9P82933 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPS9P82933 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPS9P82933 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPS9P82933 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPS9P82933 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPS9P82933 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPS9P82933 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPS9P82933 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPS9P82933 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPS9P82933 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPS9P82933 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPS9P82933 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPS9P82933 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPS9P82933 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPS9P82933 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPS9P82933 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPS9P82933 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPS9P82933 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPS9P82933 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPS9P82933 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPS9P82933 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPS9P82933 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPS9P82933 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPS9P82933 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPS9P82933 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPS9P82933 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPS9P82933 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPS9P82933 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPS9P82933 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPS9P82933 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPS9P82933 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPS9P82933 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPS9P82933 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPS9P82933 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPS9P82933 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPS9P82933 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPS9P82933 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPS9P82933 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPS9P82933 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPS9P82933 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPS9P82933 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPS9P82933 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPS9P82933 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPS9P82933 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPS9P82933 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPS9P82933 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPS9P82933 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPS9P82933 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPS9P82933 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPS9P82933 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPS9P82933 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPS9P82933 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPS9P82933 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPS9P82933 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPS9P82933 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPS9P82933 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPS9P82933 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPS9P82933 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRPS9P82933 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRPS9P82933 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRPS9P82933 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRPS9P82933 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRPS9P82933 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRPS9P82933 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRPS9P82933 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRPS9P82933 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms