Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CRB1P82279 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CRB1P82279 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CRB1P82279 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CRB1P82279 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CRB1P82279 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CRB1P82279 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CRB1P82279 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CRB1P82279 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CRB1P82279 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CRB1P82279 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CRB1P82279 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CRB1P82279 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CRB1P82279 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CRB1P82279 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CRB1P82279 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CRB1P82279 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CRB1P82279 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CRB1P82279 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CRB1P82279 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CRB1P82279 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CRB1P82279 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CRB1P82279 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CRB1P82279 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CRB1P82279 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CRB1P82279 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CRB1P82279 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CRB1P82279 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CRB1P82279 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CRB1P82279 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CRB1P82279 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CRB1P82279 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CRB1P82279 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CRB1P82279 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CRB1P82279 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CRB1P82279 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CRB1P82279 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CRB1P82279 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CRB1P82279 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CRB1P82279 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CRB1P82279 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CRB1P82279 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CRB1P82279 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CRB1P82279 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CRB1P82279 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CRB1P82279 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CRB1P82279 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CRB1P82279 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CRB1P82279 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CRB1P82279 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CRB1P82279 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CRB1P82279 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CRB1P82279 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CRB1P82279 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CRB1P82279 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CRB1P82279 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CRB1P82279 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CRB1P82279 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CRB1P82279 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CRB1P82279 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CRB1P82279 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CRB1P82279 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CRB1P82279 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CRB1P82279 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CRB1P82279 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CRB1P82279 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CRB1P82279 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CRB1P82279 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CRB1P82279 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CRB1P82279 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CRB1P82279 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CRB1P82279 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CRB1P82279 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CRB1P82279 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CRB1P82279 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CRB1P82279 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CRB1P82279 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CRB1P82279 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CRB1P82279 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CRB1P82279 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CRB1P82279 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CRB1P82279 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CRB1P82279 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CRB1P82279 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CRB1P82279 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CRB1P82279 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CRB1P82279 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CRB1P82279 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CRB1P82279 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CRB1P82279 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CRB1P82279 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CRB1P82279 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CRB1P82279 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CRB1P82279 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
CRB1P82279 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CRB1P82279 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CRB1P82279 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CRB1P82279 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CRB1P82279 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CRB1P82279 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms