Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
POLR2FP61218 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
POLR2FP61218 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
POLR2FP61218 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
POLR2FP61218 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
POLR2FP61218 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms