Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms