Protein–RNA interactions for Protein: P56693

SOX10, Transcription factor SOX-10, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX10P56693 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX10P56693 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX10P56693 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX10P56693 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SOX10P56693 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX10P56693 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX10P56693 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX10P56693 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX10P56693 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX10P56693 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX10P56693 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX10P56693 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX10P56693 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX10P56693 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX10P56693 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX10P56693 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX10P56693 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX10P56693 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOX10P56693 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOX10P56693 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOX10P56693 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOX10P56693 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOX10P56693 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOX10P56693 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOX10P56693 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOX10P56693 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOX10P56693 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOX10P56693 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOX10P56693 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SOX10P56693 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOX10P56693 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOX10P56693 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOX10P56693 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOX10P56693 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SOX10P56693 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOX10P56693 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOX10P56693 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOX10P56693 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX10P56693 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX10P56693 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX10P56693 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX10P56693 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX10P56693 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX10P56693 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX10P56693 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX10P56693 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX10P56693 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX10P56693 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX10P56693 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX10P56693 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX10P56693 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX10P56693 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX10P56693 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX10P56693 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX10P56693 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX10P56693 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX10P56693 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX10P56693 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX10P56693 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX10P56693 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX10P56693 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX10P56693 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX10P56693 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX10P56693 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX10P56693 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX10P56693 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX10P56693 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX10P56693 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX10P56693 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX10P56693 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX10P56693 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX10P56693 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX10P56693 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX10P56693 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX10P56693 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX10P56693 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX10P56693 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX10P56693 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX10P56693 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX10P56693 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX10P56693 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX10P56693 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX10P56693 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX10P56693 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX10P56693 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX10P56693 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX10P56693 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX10P56693 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX10P56693 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX10P56693 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX10P56693 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX10P56693 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX10P56693 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX10P56693 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX10P56693 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX10P56693 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX10P56693 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX10P56693 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX10P56693 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOX10P56693 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms