Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms