Protein–RNA interactions for Protein: P56202

CTSW, Cathepsin W, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSWP56202 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTSWP56202 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTSWP56202 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTSWP56202 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTSWP56202 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTSWP56202 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTSWP56202 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTSWP56202 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTSWP56202 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTSWP56202 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTSWP56202 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTSWP56202 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTSWP56202 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTSWP56202 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTSWP56202 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTSWP56202 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTSWP56202 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTSWP56202 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTSWP56202 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTSWP56202 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTSWP56202 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTSWP56202 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTSWP56202 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTSWP56202 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTSWP56202 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTSWP56202 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTSWP56202 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTSWP56202 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTSWP56202 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CTSWP56202 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTSWP56202 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTSWP56202 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CTSWP56202 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTSWP56202 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CTSWP56202 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTSWP56202 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CTSWP56202 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CTSWP56202 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTSWP56202 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTSWP56202 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTSWP56202 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CTSWP56202 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTSWP56202 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTSWP56202 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTSWP56202 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTSWP56202 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTSWP56202 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTSWP56202 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTSWP56202 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CTSWP56202 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTSWP56202 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTSWP56202 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTSWP56202 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTSWP56202 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTSWP56202 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTSWP56202 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTSWP56202 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTSWP56202 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTSWP56202 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTSWP56202 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTSWP56202 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTSWP56202 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTSWP56202 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTSWP56202 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTSWP56202 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTSWP56202 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTSWP56202 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTSWP56202 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTSWP56202 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTSWP56202 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTSWP56202 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTSWP56202 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CTSWP56202 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTSWP56202 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTSWP56202 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTSWP56202 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CTSWP56202 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CTSWP56202 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTSWP56202 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTSWP56202 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CTSWP56202 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTSWP56202 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTSWP56202 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CTSWP56202 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTSWP56202 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTSWP56202 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CTSWP56202 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTSWP56202 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTSWP56202 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTSWP56202 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTSWP56202 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTSWP56202 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTSWP56202 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTSWP56202 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTSWP56202 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTSWP56202 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CTSWP56202 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTSWP56202 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTSWP56202 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTSWP56202 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms