Protein–RNA interactions for Protein: P53814

SMTN, Smoothelin, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNP53814 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMTNP53814 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMTNP53814 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMTNP53814 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMTNP53814 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMTNP53814 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMTNP53814 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMTNP53814 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SMTNP53814 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMTNP53814 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMTNP53814 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMTNP53814 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMTNP53814 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMTNP53814 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMTNP53814 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMTNP53814 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMTNP53814 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMTNP53814 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMTNP53814 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SMTNP53814 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMTNP53814 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMTNP53814 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMTNP53814 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMTNP53814 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMTNP53814 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMTNP53814 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMTNP53814 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMTNP53814 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMTNP53814 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMTNP53814 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMTNP53814 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMTNP53814 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMTNP53814 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMTNP53814 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMTNP53814 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMTNP53814 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMTNP53814 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMTNP53814 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMTNP53814 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMTNP53814 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMTNP53814 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMTNP53814 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMTNP53814 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMTNP53814 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMTNP53814 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMTNP53814 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMTNP53814 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SMTNP53814 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMTNP53814 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMTNP53814 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SMTNP53814 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMTNP53814 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMTNP53814 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMTNP53814 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMTNP53814 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMTNP53814 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMTNP53814 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMTNP53814 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMTNP53814 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMTNP53814 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMTNP53814 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMTNP53814 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMTNP53814 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMTNP53814 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMTNP53814 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMTNP53814 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMTNP53814 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMTNP53814 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMTNP53814 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SMTNP53814 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMTNP53814 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMTNP53814 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SMTNP53814 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMTNP53814 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMTNP53814 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMTNP53814 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMTNP53814 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMTNP53814 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMTNP53814 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMTNP53814 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMTNP53814 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMTNP53814 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMTNP53814 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMTNP53814 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMTNP53814 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SMTNP53814 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMTNP53814 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SMTNP53814 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMTNP53814 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SMTNP53814 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMTNP53814 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMTNP53814 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SMTNP53814 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SMTNP53814 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SMTNP53814 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SMTNP53814 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMTNP53814 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMTNP53814 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMTNP53814 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMTNP53814 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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