Protein–RNA interactions for Protein: P52798

EFNA4, Ephrin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA4P52798 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA4P52798 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA4P52798 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA4P52798 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA4P52798 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA4P52798 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA4P52798 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA4P52798 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA4P52798 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA4P52798 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA4P52798 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA4P52798 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA4P52798 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA4P52798 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA4P52798 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA4P52798 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA4P52798 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNA4P52798 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNA4P52798 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNA4P52798 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNA4P52798 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNA4P52798 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNA4P52798 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNA4P52798 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNA4P52798 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNA4P52798 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNA4P52798 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNA4P52798 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNA4P52798 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNA4P52798 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNA4P52798 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNA4P52798 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNA4P52798 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNA4P52798 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNA4P52798 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNA4P52798 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNA4P52798 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNA4P52798 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNA4P52798 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNA4P52798 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EFNA4P52798 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EFNA4P52798 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EFNA4P52798 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EFNA4P52798 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
EFNA4P52798 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EFNA4P52798 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EFNA4P52798 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms