Protein–RNA interactions for Protein: P51957

NEK4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, humanhuman

Predictions only

Length 841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK4P51957 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEK4P51957 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEK4P51957 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEK4P51957 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEK4P51957 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEK4P51957 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEK4P51957 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEK4P51957 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEK4P51957 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEK4P51957 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
NEK4P51957 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
NEK4P51957 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NEK4P51957 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEK4P51957 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NEK4P51957 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEK4P51957 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEK4P51957 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEK4P51957 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEK4P51957 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEK4P51957 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEK4P51957 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEK4P51957 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEK4P51957 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEK4P51957 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEK4P51957 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEK4P51957 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEK4P51957 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEK4P51957 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEK4P51957 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEK4P51957 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEK4P51957 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEK4P51957 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEK4P51957 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEK4P51957 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEK4P51957 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEK4P51957 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEK4P51957 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEK4P51957 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEK4P51957 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEK4P51957 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEK4P51957 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEK4P51957 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEK4P51957 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEK4P51957 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEK4P51957 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEK4P51957 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEK4P51957 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEK4P51957 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEK4P51957 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEK4P51957 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEK4P51957 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEK4P51957 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEK4P51957 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEK4P51957 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEK4P51957 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEK4P51957 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEK4P51957 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEK4P51957 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEK4P51957 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEK4P51957 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEK4P51957 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEK4P51957 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEK4P51957 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEK4P51957 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEK4P51957 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEK4P51957 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEK4P51957 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEK4P51957 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEK4P51957 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEK4P51957 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEK4P51957 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEK4P51957 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEK4P51957 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEK4P51957 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEK4P51957 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEK4P51957 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEK4P51957 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEK4P51957 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEK4P51957 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEK4P51957 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEK4P51957 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEK4P51957 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEK4P51957 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEK4P51957 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEK4P51957 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEK4P51957 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEK4P51957 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEK4P51957 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEK4P51957 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEK4P51957 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEK4P51957 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEK4P51957 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEK4P51957 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEK4P51957 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEK4P51957 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEK4P51957 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEK4P51957 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEK4P51957 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEK4P51957 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEK4P51957 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms