Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPFP49454 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPFP49454 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPFP49454 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPFP49454 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPFP49454 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPFP49454 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPFP49454 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPFP49454 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPFP49454 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPFP49454 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPFP49454 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPFP49454 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPFP49454 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPFP49454 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPFP49454 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPFP49454 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPFP49454 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPFP49454 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPFP49454 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPFP49454 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPFP49454 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPFP49454 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPFP49454 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPFP49454 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CENPFP49454 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CENPFP49454 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CENPFP49454 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CENPFP49454 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CENPFP49454 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CENPFP49454 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CENPFP49454 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CENPFP49454 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CENPFP49454 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CENPFP49454 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CENPFP49454 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CENPFP49454 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPFP49454 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPFP49454 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPFP49454 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPFP49454 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPFP49454 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPFP49454 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPFP49454 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPFP49454 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPFP49454 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPFP49454 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPFP49454 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPFP49454 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPFP49454 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPFP49454 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPFP49454 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPFP49454 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPFP49454 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPFP49454 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPFP49454 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPFP49454 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPFP49454 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPFP49454 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPFP49454 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPFP49454 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPFP49454 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPFP49454 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPFP49454 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPFP49454 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPFP49454 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPFP49454 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPFP49454 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPFP49454 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPFP49454 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPFP49454 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPFP49454 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPFP49454 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPFP49454 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPFP49454 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPFP49454 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPFP49454 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPFP49454 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPFP49454 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPFP49454 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPFP49454 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPFP49454 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPFP49454 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPFP49454 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPFP49454 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPFP49454 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPFP49454 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPFP49454 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPFP49454 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPFP49454 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPFP49454 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPFP49454 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPFP49454 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPFP49454 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPFP49454 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPFP49454 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPFP49454 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPFP49454 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPFP49454 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPFP49454 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms