Protein–RNA interactions for Protein: P43119

PTGIR, Prostacyclin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGIRP43119 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms