Protein–RNA interactions for Protein: P35749

MYH11, Myosin-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,972 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH11P35749 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MYH11P35749 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MYH11P35749 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MYH11P35749 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MYH11P35749 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MYH11P35749 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MYH11P35749 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MYH11P35749 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MYH11P35749 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MYH11P35749 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MYH11P35749 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MYH11P35749 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MYH11P35749 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MYH11P35749 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MYH11P35749 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MYH11P35749 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MYH11P35749 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MYH11P35749 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MYH11P35749 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MYH11P35749 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MYH11P35749 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MYH11P35749 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MYH11P35749 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MYH11P35749 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MYH11P35749 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MYH11P35749 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
MYH11P35749 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MYH11P35749 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MYH11P35749 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
MYH11P35749 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MYH11P35749 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MYH11P35749 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MYH11P35749 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MYH11P35749 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MYH11P35749 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MYH11P35749 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MYH11P35749 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MYH11P35749 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MYH11P35749 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MYH11P35749 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
MYH11P35749 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MYH11P35749 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
MYH11P35749 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MYH11P35749 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
MYH11P35749 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
MYH11P35749 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MYH11P35749 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MYH11P35749 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MYH11P35749 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MYH11P35749 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MYH11P35749 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MYH11P35749 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MYH11P35749 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
MYH11P35749 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MYH11P35749 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MYH11P35749 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MYH11P35749 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MYH11P35749 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MYH11P35749 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MYH11P35749 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MYH11P35749 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MYH11P35749 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MYH11P35749 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MYH11P35749 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MYH11P35749 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MYH11P35749 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MYH11P35749 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MYH11P35749 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MYH11P35749 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MYH11P35749 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MYH11P35749 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
MYH11P35749 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MYH11P35749 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MYH11P35749 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MYH11P35749 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MYH11P35749 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MYH11P35749 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MYH11P35749 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MYH11P35749 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MYH11P35749 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MYH11P35749 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MYH11P35749 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MYH11P35749 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MYH11P35749 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MYH11P35749 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MYH11P35749 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MYH11P35749 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
MYH11P35749 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
MYH11P35749 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
MYH11P35749 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
MYH11P35749 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
MYH11P35749 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.07
MYH11P35749 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
MYH11P35749 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MYH11P35749 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MYH11P35749 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MYH11P35749 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MYH11P35749 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MYH11P35749 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MYH11P35749 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms