Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ABCC1P33527 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ABCC1P33527 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ABCC1P33527 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ABCC1P33527 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ABCC1P33527 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ABCC1P33527 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ABCC1P33527 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ABCC1P33527 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ABCC1P33527 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ABCC1P33527 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ABCC1P33527 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
ABCC1P33527 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ABCC1P33527 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ABCC1P33527 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
ABCC1P33527 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ABCC1P33527 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ABCC1P33527 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ABCC1P33527 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ABCC1P33527 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ABCC1P33527 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ABCC1P33527 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ABCC1P33527 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ABCC1P33527 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
ABCC1P33527 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
ABCC1P33527 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
ABCC1P33527 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ABCC1P33527 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ABCC1P33527 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ABCC1P33527 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ABCC1P33527 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ABCC1P33527 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ABCC1P33527 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ABCC1P33527 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ABCC1P33527 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ABCC1P33527 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ABCC1P33527 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ABCC1P33527 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ABCC1P33527 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
ABCC1P33527 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
ABCC1P33527 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ABCC1P33527 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ABCC1P33527 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
ABCC1P33527 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ABCC1P33527 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ABCC1P33527 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ABCC1P33527 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ABCC1P33527 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ABCC1P33527 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ABCC1P33527 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ABCC1P33527 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ABCC1P33527 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
ABCC1P33527 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ABCC1P33527 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ABCC1P33527 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ABCC1P33527 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ABCC1P33527 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ABCC1P33527 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ABCC1P33527 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ABCC1P33527 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ABCC1P33527 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ABCC1P33527 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ABCC1P33527 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ABCC1P33527 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
ABCC1P33527 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
ABCC1P33527 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ABCC1P33527 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ABCC1P33527 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ABCC1P33527 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ABCC1P33527 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ABCC1P33527 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ABCC1P33527 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ABCC1P33527 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ABCC1P33527 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ABCC1P33527 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ABCC1P33527 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ABCC1P33527 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ABCC1P33527 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
ABCC1P33527 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ABCC1P33527 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ABCC1P33527 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ABCC1P33527 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
ABCC1P33527 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ABCC1P33527 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ABCC1P33527 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ABCC1P33527 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
ABCC1P33527 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
ABCC1P33527 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.36
ABCC1P33527 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
ABCC1P33527 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
ABCC1P33527 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.36
ABCC1P33527 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
ABCC1P33527 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ABCC1P33527 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ABCC1P33527 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ABCC1P33527 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ABCC1P33527 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ABCC1P33527 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ABCC1P33527 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ABCC1P33527 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms