Protein–RNA interactions for Protein: P32780

GTF2H1, General transcription factor IIH subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H1P32780 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2H1P32780 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2H1P32780 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2H1P32780 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2H1P32780 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2H1P32780 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2H1P32780 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2H1P32780 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2H1P32780 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2H1P32780 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GTF2H1P32780 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2H1P32780 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2H1P32780 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2H1P32780 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2H1P32780 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2H1P32780 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2H1P32780 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2H1P32780 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2H1P32780 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GTF2H1P32780 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2H1P32780 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2H1P32780 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2H1P32780 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2H1P32780 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2H1P32780 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2H1P32780 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2H1P32780 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2H1P32780 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2H1P32780 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2H1P32780 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2H1P32780 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2H1P32780 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2H1P32780 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2H1P32780 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2H1P32780 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2H1P32780 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GTF2H1P32780 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2H1P32780 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2H1P32780 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2H1P32780 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2H1P32780 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2H1P32780 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2H1P32780 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2H1P32780 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2H1P32780 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2H1P32780 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2H1P32780 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2H1P32780 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2H1P32780 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2H1P32780 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2H1P32780 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2H1P32780 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2H1P32780 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2H1P32780 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2H1P32780 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2H1P32780 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2H1P32780 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2H1P32780 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2H1P32780 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2H1P32780 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2H1P32780 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2H1P32780 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2H1P32780 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2H1P32780 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2H1P32780 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2H1P32780 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2H1P32780 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2H1P32780 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2H1P32780 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2H1P32780 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2H1P32780 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2H1P32780 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2H1P32780 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2H1P32780 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2H1P32780 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2H1P32780 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2H1P32780 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2H1P32780 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2H1P32780 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2H1P32780 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2H1P32780 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2H1P32780 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2H1P32780 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2H1P32780 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2H1P32780 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2H1P32780 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2H1P32780 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2H1P32780 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2H1P32780 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2H1P32780 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2H1P32780 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2H1P32780 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2H1P32780 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2H1P32780 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2H1P32780 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2H1P32780 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2H1P32780 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2H1P32780 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2H1P32780 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2H1P32780 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms