Protein–RNA interactions for Protein: P30511

HLA-F, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain F, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-FP30511 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-FP30511 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-FP30511 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-FP30511 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-FP30511 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-FP30511 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-FP30511 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-FP30511 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-FP30511 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-FP30511 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-FP30511 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-FP30511 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-FP30511 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-FP30511 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-FP30511 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-FP30511 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-FP30511 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-FP30511 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-FP30511 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-FP30511 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-FP30511 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-FP30511 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-FP30511 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-FP30511 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-FP30511 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-FP30511 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-FP30511 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-FP30511 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-FP30511 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-FP30511 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-FP30511 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-FP30511 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-FP30511 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-FP30511 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-FP30511 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-FP30511 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-FP30511 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-FP30511 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-FP30511 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HLA-FP30511 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HLA-FP30511 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HLA-FP30511 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HLA-FP30511 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HLA-FP30511 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HLA-FP30511 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HLA-FP30511 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HLA-FP30511 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HLA-FP30511 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HLA-FP30511 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HLA-FP30511 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HLA-FP30511 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HLA-FP30511 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HLA-FP30511 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HLA-FP30511 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HLA-FP30511 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HLA-FP30511 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HLA-FP30511 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HLA-FP30511 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HLA-FP30511 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HLA-FP30511 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HLA-FP30511 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HLA-FP30511 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HLA-FP30511 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HLA-FP30511 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HLA-FP30511 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HLA-FP30511 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HLA-FP30511 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HLA-FP30511 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HLA-FP30511 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HLA-FP30511 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HLA-FP30511 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HLA-FP30511 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HLA-FP30511 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HLA-FP30511 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HLA-FP30511 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HLA-FP30511 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HLA-FP30511 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HLA-FP30511 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HLA-FP30511 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HLA-FP30511 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
HLA-FP30511 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HLA-FP30511 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HLA-FP30511 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HLA-FP30511 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HLA-FP30511 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HLA-FP30511 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HLA-FP30511 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HLA-FP30511 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HLA-FP30511 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HLA-FP30511 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HLA-FP30511 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HLA-FP30511 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HLA-FP30511 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HLA-FP30511 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HLA-FP30511 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HLA-FP30511 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HLA-FP30511 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HLA-FP30511 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HLA-FP30511 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HLA-FP30511 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms